Yo lo enganché y logré hundirlo en una de las misiones. Siempre en el caso de buques grandes tenés que usar los torpedos para que pasen entre 1 y 2 metros por debajo de la quilla, con detonación magnética y tratando de que la salva de torpedos impacte en forma regular (o sea, no todos en el mismo punto), pero ditribuídos entre la proa y el centro del barco o entre el centro y la popa. Con esto logramos que el barco no se hunda parejo, sinó mas bien que se incline sobre proa o popa.
Además, particularmente en el Yamato (si alguien sabe como está diagramado en el SH4 que lo confirme), pareciera que los compartimentos estancos están separados en forma transversal y longitudinal (como si fuera una gran cubetera de hielo de la heladera), ya que me pasó que al realizar el ataque, en vez de hundirse la popa como esperaba, el Yamato se escoró, indicando que los compartimentos del lado que ataqué se innundaron, pero los del otro lado no.
EDIT: Ah, necesité 8 torpedos para mandarlo al fondo.