Mi recomendación es siempre :
Una carpeta de la instalación del DVD, para tener siempre esa versión como backup y para futuros mods, parches, etc etc.
Otra carpeta con la oficial 4.11 que en el futuro será la 4.12. (Sencillo, duplicas la del dvd e instalas todos los parches oficiales)
Otra carpeta con UP 3.0 RC4 (Igual, duplicas la del DVD e instalas UP 3.0)
Otra carpeta con HSFX 6.0.X (igual...).
Chapas lo explica muy bien en un post : http://www.escuadron69.net/v20/foro/index.php?/topic/52060-ultimas-versiones-del-il2-1946-y-de-los-paquetes-de-mods-up-y-hsfx/
Además visita el post para configurar una sola instalación de Hyperlobby para todas las versiones mediante accesos directos.
http://www.escuadron69.net/v20/foro/index.php?/topic/49851-1-hyperlobby-multiples-il-2/
Poco más !. Yo por ejemplo lo tengo puesto en una carpeta IL2 y dentro de ésta tengo DVD, OFICIAL, HSFX, UP. 4 Instalaciones diferentes !
Un saludo