guss, te complicas la vida instalando software en dos particiones distintas. Piensa que si tienes que formatear la partición del OS, en la otra te quedará mucho software que ya no funcionará, al haberse borrado el registro con el formateo, estará en carpetas que muchas veces no sabrás lo que contiene, y eso con el tiempo es mierda en el HD. Además, no tiene ninguna ventaja. La única ventaja a nivel de usuario es tener el software y SO en una partición y los datos en otra. Si tienes un HD usb, empléalo para guardar lo que tengas en la partición de datos, más todo aquello que sea de poco uso y/o no importante.